LabDAO planira budućnost umjetne inteligencije otvorenog koda za otkrivanje lijekova

Projekt Folding@home dospio je na naslovnice tijekom pandemije COVID-19 zbog usmjeravanja neiskorištene računalne snage za istraživanje prostora pretraživanja savijanja proteina u borbi protiv novog koronavirusa. Osnažujući građane da sami budu znanstvenici, inicijativa je pokrenula velike simulacije različitih molekularnih konfiguracija proteina preko distribuirane mreže "upisanih" računala diljem svijeta.

Ova decentralizirana paradigma najavljena je za okupljanje ljudi oko zajedničkog problema i učinkovito prikupljanje računalne snage, ali što ako su računalna snaga i infrastruktura za rješavanje problema obrnuti? Drugim riječima, što ako bi pojedinci mogli pokrenuti vlastite projekte koristeći akumuliranu računalnu snagu i alate za biološko eksperimentiranje za početak?

LabDAO taj san pretvara u stvarnost sa svojom PLEX platformom. PLEX je alat naredbenog retka otvorenog koda osmišljen kako bi učinio dostupnima ne samo računalne resurse, već i niz alata za biološko-strojno učenje (skovan paket "BioML" unutar LabDAO) u različitim sredinama. Bilo da eksperimentirate s vlastitim simulacijama spajanja malih molekula ili savijanja proteina, PLEX korisnicima omogućuje pristup LabDAO biblioteci alata, dijeljenje rezultata i vizualizaciju istih u manje od pet minuta.

Ovaj paket alata i njegova platforma koja omogućuje korištenje povrh toga bili su izloženi na Zuzaluovom Blockchain Meets Biology summitu početkom travnja, gdje je članica LabDAO Core tima Lily Hansen-Gillis demonstrirala od početka do kraja simulaciju unutarnje molekularne dinamike proteina kako bi pronašao svoju najstabilniju konfiguraciju. Zatim je, kao samozvani "nekoder", provela publiku kroz to od početka do kraja - sve s računalom, WiFi-em, PLEX-om na naredbenom retku i ničim više.

U širem smislu, LabDAO je decentralizirana platforma omogućena za web3 (dio većeg pokreta "DeSci") posvećena stvaranju produktivnijeg okruženja za otkrivanje lijekova s ​​otvorenim kodom. Čineći najnovije alate i resurse dostupnima širem ekosustavu, LabDAO ima za cilj stvoriti pravo okruženje za transparentan i dostupan znanstveni napredak. Bilo uklanjanjem potrebe da istraživači imaju vlastitu hardversku ili računalnu infrastrukturu ili objavljivanjem rezultata eksperimenata na blockchain glavnoj knjizi tako da ih je moguće pratiti i reproducirati, organizacija je predana stvaranju više inovacija mogućim kroz suradnju — rušenje prepreka uzrokovanih lošim upotrebljivost i silosirana, nišna stručnost.

LabDAO-ovi napori da izgradi ovaj DeSci svijet budućnosti za danas nedavno su dobili poticaj u obliku runde financiranja od 3.6 milijuna dolara od raznih drugih DAO-ova, Inflection.xyz, Balaji Srinivasan i drugih. Ovaj priljev podrške pridonijet će stalnim naporima za izgradnju softverskih alata otvorenog koda i ojačati LabDAO-ov istraživački ekosustav.

Što se samog PLEX-a tiče, neposredni sljedeći koraci na horizontu uključuju testiranje platforme u različitim znanstvenim suradnjama, kontejneriziranje raznih alata i prikupljanje potrebnog hardvera za poticanje BioML mreže.

Što se dugoročno tiče, možda će sljedeći lijek koji će spasiti život tijekom sljedeće velike epidemije zarazne bolesti biti dizajniran sa snagom PLEX-a, jedan po jedan decentralizirani korak naprijed. Kako ekosustav nastavlja rasti, samo će vrijeme pokazati.

Hvala i tebi Aishani Aatresh za dodatno istraživanje i izvješćivanje o ovom članku. Osnivač sam SynBioBeta, a neke od tvrtki o kojima pišem su sponzori SynBioBeta konferencija. Za više sadržaja, možete se pretplatiti na moj tjedni bilten.